??????蛋白質(zhì)組學(xué)本質(zhì)上指的是在大規(guī)模水平上研究蛋白質(zhì)的特征,包括蛋白質(zhì)的表達(dá)水平,翻譯后的修飾,蛋白與蛋白相互作用等,由此獲得蛋白質(zhì)水平上的關(guān)于疾病發(fā)生,細(xì)胞代謝等過程的整體而全面的認(rèn)識(shí)。是系統(tǒng)地研究生物學(xué)規(guī)律和機(jī)制的成熟并且有效的工具。
??????以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的定量蛋白質(zhì)組學(xué),主要可以分成兩類,第一種是穩(wěn)定同位素標(biāo)記的定量蛋白質(zhì)組學(xué),比如iTRAQ;第二種是非標(biāo)記的定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù),比如label-free。iTRAQ定性定量結(jié)果更為準(zhǔn)確,通量較高可同時(shí)標(biāo)記2-8個(gè)樣本,但是對(duì)樣本數(shù)有一定限制且不適用于低豐度蛋白的定量,適合小樣本量的項(xiàng)目;label-free檢測(cè)肽段范圍廣,單次可鑒定和定量較多的蛋白質(zhì),但由于樣品單獨(dú)進(jìn)行質(zhì)譜檢測(cè)所以重現(xiàn)性較低,在大量算法的基礎(chǔ)上更適合大量樣本的蛋白組研究。
技術(shù)方法 | 優(yōu)點(diǎn) | 缺點(diǎn) |
iTRAQ | 定量準(zhǔn)確、可信度高 蛋白通量高(8標(biāo))、覆蓋度高 自動(dòng)化程度高、分析時(shí)間快、分離效果好 分離能力強(qiáng)、分析范圍廣、定性結(jié)果可靠 |
需同位素標(biāo)記,成本較高 樣本數(shù)受限制,只可平行分析2-8個(gè)樣本 樣本處理過程容易引入誤差 只能檢測(cè)差異蛋白 |
label-free | 實(shí)驗(yàn)成本低、無需同位素 樣本數(shù)不受限制,適用大樣本 對(duì)樣本的操作較少,所需樣本量低 檢測(cè)肽段范圍寬,有利于低豐度蛋白質(zhì)檢測(cè) 可以鑒定蛋白的有無 |
數(shù)據(jù)處理復(fù)雜 對(duì)質(zhì)譜結(jié)果穩(wěn)定性依賴高 影響重復(fù)性和定量準(zhǔn)確性 |
??????蛋白質(zhì)組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)都是系統(tǒng)地研究生物學(xué)規(guī)律和機(jī)制的成熟并且有效的工具,由于生命體是一個(gè)多層次、多功能的復(fù)雜結(jié)構(gòu)體,所以單一組學(xué)技術(shù)不能全景地揭示生命活動(dòng)的本質(zhì)規(guī)律。采用蛋白質(zhì)組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)同步檢測(cè)蛋白質(zhì)及RNA的整體狀態(tài),并且將這兩個(gè)組學(xué)的數(shù)據(jù)整合起來分析,不僅能在蛋白質(zhì)水平及轉(zhuǎn)錄水平兩個(gè)不同層次上透視生命活動(dòng)的規(guī)律與本質(zhì),還能揭示二者之間的相互調(diào)控作用或者關(guān)聯(lián)。
公司成立以來,在國(guó)際知名雜志合作發(fā)表文章近千篇,累計(jì)影響因子超過4500分。
擁有豐富的項(xiàng)目分析經(jīng)驗(yàn),至今累計(jì)完成 近300個(gè)物種5?萬多個(gè)樣品的研究
可根據(jù)項(xiàng)目需要選擇合適的分析方案,保障結(jié)果精準(zhǔn)
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