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百創(chuàng)S系列空間轉(zhuǎn)錄組細(xì)胞分割

技術(shù)原理

百創(chuàng)智造S系列空間轉(zhuǎn)錄組細(xì)胞分割實(shí)現(xiàn)原理: 三圖合一 百創(chuàng)智造基于S系列空間芯片的底層設(shè)計(jì),開發(fā)出了自己的核心技術(shù),可以得到完全沒有錯(cuò)誤的原片熒光圖像以及H&E圖像且與芯片完全對(duì)齊?;跓晒膺M(jìn)行細(xì)胞核的定位刻畫細(xì)胞核的邊界;基于HE的校準(zhǔn)輔助刻畫細(xì)胞的邊界,通過邊界信息映射到芯片上,提取相應(yīng)位置的測(cè)序數(shù)據(jù),實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)的單細(xì)胞分割。

輔助軟件

同時(shí),對(duì)于細(xì)胞類型差異大的片子以及植物樣本,百創(chuàng)智造也匹配了免費(fèi)的可視化軟BSTCellViewer,可以手動(dòng)進(jìn)行細(xì)胞的修改、圈定。

產(chǎn)品特點(diǎn)

亞細(xì)胞級(jí)分辨率

分辨率最高可達(dá)4.8μm,較國外主流技術(shù)分辨率提高400倍。

原片熒光染色+原片H&E染色+原片空間測(cè)序相結(jié)合技術(shù)

既可以進(jìn)行表達(dá)芯片H&E染色,又同時(shí)可以再表達(dá)芯片上進(jìn)行熒光染色,保證細(xì)胞分割更準(zhǔn)確。

靈活樣本策略

可根據(jù)樣本數(shù)量,靈活定制1~8個(gè)捕獲區(qū)域,且還可以根據(jù)組織大小,選擇3中不同面積(6.8mm*6.8mm、11mm*11mm、15mm*20mm)的捕獲區(qū)域大小。

無錯(cuò)位且高清的圖像

芯片采用半導(dǎo)體加工級(jí)別的微孔矩陣,以及提供BSTCellViewer細(xì)胞圈定軟件,可以實(shí)現(xiàn)對(duì)原片進(jìn)行單細(xì)胞圈定,分割實(shí)現(xiàn)以單細(xì)胞為單位進(jìn)行聚類分析。

部分?jǐn)?shù)據(jù)

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