百創(chuàng)S1000(BMKMANU S1000)是由百邁客生物設(shè)計(jì)并研發(fā)而來(lái)的基于微孔微珠上Spatial Barcode實(shí)現(xiàn)對(duì)組織切片mRNA分子捕獲的亞細(xì)胞級(jí)空間轉(zhuǎn)錄組芯片。百創(chuàng)S1000可以廣泛應(yīng)用于生物器官發(fā)育、神經(jīng)科學(xué)、免疫感染、脅迫應(yīng)激、生物遺傳進(jìn)化等生命科學(xué)領(lǐng)域的研究。
哺乳動(dòng)物體細(xì)胞平均直徑為10μm,百創(chuàng)S1000空間轉(zhuǎn)錄芯片分辨率達(dá)到了4.8μm,到達(dá)亞細(xì)胞級(jí)別。
百創(chuàng)S1000空間轉(zhuǎn)錄芯片結(jié)果支持從100μm-4.8μm動(dòng)態(tài)調(diào)整。
百創(chuàng)S1000空間轉(zhuǎn)錄芯片保留原片HE染色,結(jié)合高分辨率的spots聚類,能得到更為精準(zhǔn)的結(jié)果。
百創(chuàng)S1000空間轉(zhuǎn)錄芯片支持1-8個(gè)捕獲區(qū)域的靈活訂制。
Nanopore有效拆分了接近50%。
Nmuber?of?Reads | Number?of?Base | Reads?with?Valid?Barcode | Bases?with?Valid?Barcodes | N50 | Bases?Mapped?to?Transcriptome?And?with?Valid?Barcode |
105,553,898 | 70,516,281,320 | 73.85% | 73.42% | 740 | 49.55% |
二代與三代數(shù)據(jù)的UMI/Gene counts per spot的相關(guān)性還是tSEN/UMAP的降維聚類,都顯示具有非常高的一致性。這充分說(shuō)明百創(chuàng)S1000-Nanopore全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組產(chǎn)品完全可以獨(dú)立進(jìn)行數(shù)據(jù)的拆分與挖掘分析,無(wú)需依賴NGS數(shù)據(jù)的校正。
在6.8mm * 6.8mm的捕獲區(qū)域內(nèi)有約220萬(wàn)個(gè)直徑2.5μm的微孔,將布滿oligo(R1+Spatial Barcode+UMI+poly(dT)VN)直徑2.5μm的微球隨機(jī)嵌入到微孔之中,形成陣列,相鄰兩個(gè)微珠的中心距離為4.8μm。Spatial barcode 種類有為5600萬(wàn)種,提供了更為長(zhǎng)的sptail barcode長(zhǎng)度,約為70bp,這能更好的兼容三代測(cè)序,能大幅提高nanopore數(shù)據(jù)的BC識(shí)別效率。
百創(chuàng)S1000分辨率最高可達(dá)到4.8μm,相比目前主流空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序芯片精度提高了近400倍,高分辨率下HE染色組織形態(tài)學(xué)與spots聚類空間分布圖重合度更高,可以更加精準(zhǔn)識(shí)別空間基因表達(dá)的異質(zhì)性和組織區(qū)域的特異性。
百創(chuàng)S1000芯片spot直徑為2.5μm, 可針對(duì)組織亞群在多級(jí)分辨率下再聚類分群,高分辨率下組織區(qū)域聚類結(jié)果增多。
可變剪切分析
融合基因分析
經(jīng)過(guò)不斷地研發(fā)測(cè)試,百創(chuàng)S1000以完成多項(xiàng)樣本測(cè)試,實(shí)測(cè)數(shù)據(jù)也表明百創(chuàng)S1000在廣泛樣本上都擁有較好的表現(xiàn)。
產(chǎn)品主要由三套試劑盒組成:
| 寡妇熟妇高潮片AAA 一级A片囗交吞精视频 | 日本婬乱A片AAA毛片麻豆软件 | 亚国产欧洲人妻爽无码 | 麻斗传谋mv视频免费播放大全 | 国产精品海角社区在线观看 | 男女污污污动态图h | 国产精品海角社区在线观看 | 91熟女一区二区三区 | 人妻熟妇区五十六十A片一二三区 | AV不卡一区二区三区 | 久久久精品国产AV麻豆 | 国产无套内射对白 | 蜜桃久久久AAAA成人网一区 | 四川BBB揉BBB揉多人乱薍 | 丰满少妇一 A片免费 | 91人妻人人爽人人精品 | 寡妇婬乱美女国毛片 | 一级无套内谢少妇A片 | 成人性生交大免费看 | 好大好爽一区二区蜜桃 | 涩涩视频在线观看免费 | 国语精品一、二、三区 | 少妇白浆无码喷水91 | 在线亚洲AV无码秘 蜜桃医院 | 性猛交AAAA片免费看蜜桃视频 | 亚洲AV无码国产日韩一区 | 91人妻人人澡人人爽人人DVD | 五月激情综合美女久久 | 日本人妻伦在线中文字幕 | 在线观看porn网站免费 | 成人AV一区二区三区 | 国产露脸无套进入69 | 欧美精品USV一区二区 | 农村妇女野外一级A片视频 WWW 黄色视频 COM | 麻豆传媒在线观看国产 | 人人妻人人妻人人片色av | 欧美精品欧美极品欧美激情 | 亚洲欧美 va天堂人熟伦 | 久久国产乱子伦精品一区二区 | 国产一级特黄AAA大片 |