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產品介紹

百創(chuàng)DG1000利用Droplet、油滴包裹、Barcode等技術實現(xiàn)高通量的細胞捕獲??稍跇O短的時間內(110S)完成油包水的過程;儀器設計輕巧便攜;儀器使用的百創(chuàng)C1000芯片為自主設計的2×4獨立芯片,可根據上樣數(shù)量進行靈活調整;同時本產品還具有配套的分析軟件BSCMatrix。

百創(chuàng)DG1000優(yōu)勢

輕巧便攜

輕巧便攜

易于異地化使用

極速運行

極速運行

110S內完成微液滴生成

上樣靈活

上樣靈活

獨立2*4芯片

更大細胞直徑兼容

更大細胞直徑兼容

已成功支持到60μm

技術流程

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捕獲探針

種類約為88萬種,每個膠珠之上有千萬級的探針,每條探針包括四個部分,通用測序引物R1,cell barcode,UMI,poly(dT)VN ,這里我們設計了更長的CB有54個bp,更長的CB可以更好的去兼容三代測序,尤其是ONT測序,可以提升識別效率。

外包科研服務與自己操作區(qū)別

單細胞測序流程 外包科研服務 自己操作
實驗周期 ?10d 1?2d
分析周期 ?10d 1?2d
是否需要運輸 運輸時間需1?2d,可能導致細胞活性較低 不需運輸,現(xiàn)場解離,細胞活性高

周期短

外包服務實驗周期需要大約20d,自己進行文庫構建+數(shù)據分析僅需要2~4d。

保證細胞活性

珍貴樣本,直接現(xiàn)場制備單細胞溶液,避免長途運輸導致細胞活性降低。

節(jié)約成本

費用低,且可自己進行后續(xù)數(shù)據分析,節(jié)約時間成本和試劑耗材費用。

實測數(shù)據

PBMC重復性測試

將相同的PBMC細胞懸液分3份,通過3個不同實驗人員,用3臺百創(chuàng)DG1000儀器,獨立進行單細胞測序,得到了幾乎一致的細胞聚類分群結果,證明百創(chuàng)DG1000具有很好的可重復性及穩(wěn)定性。

樣品編號 數(shù)據量 上機理論細胞數(shù) 細胞數(shù) 捕獲效率 中位基因數(shù) 中位UMI數(shù) 總檢測基因數(shù)
T01 108.5G 10,000 6,598 66% 1,184 2,249 34,590
T02 101.5G 10,000 6,004 60% 1,092 1,965 33,798
T03 93.6G 10,000 5,366 54% 1,173 2,171 34,865

野生動物細胞核

相同樣本分別使用百創(chuàng)DG1000與傳統(tǒng)平臺進行數(shù)據實測。在捕獲效率、中位基因數(shù)目、總捕獲基因數(shù)方面,DG1000平臺性能要略微優(yōu)于傳統(tǒng)平臺。

樣品編號 數(shù)據量 上機理論細胞數(shù) 細胞數(shù) 捕獲效率 中位基因數(shù) 中位UMI數(shù) 總檢測基因數(shù)
DG1000 53.7G 5,000 2,735 54% 1,315 3,217 18,657
主流平臺 54.5G 10,000 5,292 53% 958 1,228 15,777

某原生動物

細胞直徑在55-60μm的原生動物,分別進行了DG1000與主流平臺的測試,主流平臺未能成功捕獲,DG1000不但捕獲成功同時得到了客戶比較認可的數(shù)據,DG1000細胞直徑成功兼容到60μm,為單細胞測序獲得更多細胞類型提供可能。