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T2T基因組

從端粒到端粒的gapfree/gapless基因組

技術介紹

T2T基因組(Telomere-to-Telomere)，即端粒至端粒的完整基因組組裝的簡稱，是更完整基因組的代表。T2T基因組主要是通過多種測序平臺、高深度測序，結合多種軟件方式來獲得具有端粒與著絲粒的的gap-free或gap-less的高質量基因組。端粒為真核生物染色體末端的一種特殊結構，由 DNA重復序列和特異結合蛋白組成的復合體。高等生物的著絲粒由數千個高度重復單元串聯(lián)形成。而這些重復區(qū)域高度復雜，是三代測序與組裝中的難點，也是T2T基因組重點攻克對象。T2T基因組的構建將進一步助力物種基因組中復雜區(qū)域的解析，尤其是早期難以被破解的“黑色領域”，可為物種的深度研究提供重要的基礎信息。

T2T基因組解析高度復雜區(qū)域 Gladman N et al., Current Opinion in Biotechnology, 2023

技術特點

  • 可以獲得高準確性、高連續(xù)性、高完整性的端粒到端粒的高質量基因組

  • 可以克服著絲粒和高重復區(qū)域的組裝難題

  • 可以克服著絲粒和高重復區(qū)域的組裝難題

  • 探索染色體的起源, 馴化以及鑒定性別關鍵基因

技術路線

T2T基因組技術路線

測序策略

測序類型

完成周期

組裝指標

測序深度

文庫大小
PacBio?HiFi 3-6個月（組裝注釋）

（視物種具體情況而定）

 至少一條染色體達到T2T

（視物種具體情況而定）

 基因組≥60x 15-20kb
ONT?Ultra-long 基因組≥40x 50kb/100kb/150kb

結果展示

家雞T2T基因組組裝 (Huang Z et al., PNAS, 2023)
西瓜G42 T2T基因組與97103v2基因組共線性分析 (Deng Y et al., Molecular Plant, 2020)

百邁客生物服務優(yōu)勢

同時具備主流三代測序平臺PacBio與Nanopore，通量充足，測序模式隨心選

多年基因組組裝項目經驗，專業(yè)的個性化分析團隊，T2T基因組可輕松應對

基因組成功案例200+，影響因子2000+

實驗與生信分析，軟著+專利雙重加持

合作案例文獻

百邁客生物服務流程

  • 樣品寄送

  • 建庫測序

  • 數據分析

  • 出具報告

  • 售后答疑