為什么全長比較轉(zhuǎn)錄組不做與表達(dá)量相關(guān)的分析?(1)不同物種,多拷貝基因難以確定基因的一?一對(duì)應(yīng)關(guān)系無法比較表達(dá)量;當(dāng)然,單拷貝同源基因可以確定一一對(duì)應(yīng)關(guān)系 […] 閱讀更多
Q4.如何對(duì)lncRNA進(jìn)行靶基因預(yù)測?答:基于lncRNA與其靶基因的作用方式,我們采用2種預(yù)測方法進(jìn)行l(wèi)ncRNA的順式靶基因和反式靶基因進(jìn)行預(yù)測 […] 閱讀更多
Q3.如何進(jìn)行LncRNA的鑒定?答:lncRNA的預(yù)測包含基本篩選和潛在編碼能力篩選兩部分。 (1)篩選長度≥200bp,Exon個(gè)數(shù)≥2,F(xiàn) […] 閱讀更多
Q5. 如何進(jìn)行動(dòng)植物的miRNA鑒定答: 在已知miRNA鑒定方面,我們將比對(duì)到參考基因組的reads與miRBase(v22)數(shù)據(jù)庫中的已知mi […] 閱讀更多
Q4. miRNA命名規(guī)則是怎樣的?答: 參照miRBase的命名規(guī)則:{物種名縮寫}-miR-{編號(hào)};miR-前綴后面所跟著的數(shù)字,代表命名的 […] 閱讀更多
Q2.為什么宏基因組與微生物多樣性物種注釋結(jié)果存在差異?微生物多樣性和宏基因組都會(huì)分析環(huán)境中物種的種類,但是物種的豐度在二者之間存在一定的差異,第一種原因是微生物多樣 […] 閱讀更多
2、真菌基因組準(zhǔn)完成圖是什么意思?答:真菌基因組準(zhǔn)完成圖是通過二代測序+三代測序+光學(xué)圖譜結(jié)合進(jìn)行組裝分析,將真菌基因組組裝到近染色體的水平,組 […] 閱讀更多
1、真菌基因組二代+三代具體是怎么組裝的?答:具體的組裝方法有三種,選擇組裝結(jié)果。 方法一:二代數(shù)據(jù)和三代數(shù)據(jù)測序片段混合組裝; 方法二:二代數(shù)據(jù)和三代 […] 閱讀更多
3、細(xì)菌基因組測序中比較基因組分析是什么?答:細(xì)菌基因組比較基因組分析,主要是分析有親緣關(guān)系的細(xì)菌基因之間的差別,通過比較基因組分析親緣遠(yuǎn)近關(guān)系,特有和 […] 閱讀更多