近日,北京百邁客生物科技有限公司再次引進(jìn)Nanopore平臺(tái)測(cè)序儀PromethION啦!
小科普
Nanopore平臺(tái)是新興的實(shí)時(shí)單分子納米孔測(cè)序技術(shù)平臺(tái):借助單個(gè)分子通過(guò)納米孔時(shí)引起孔兩側(cè)電位差來(lái)實(shí)現(xiàn)信號(hào)檢測(cè),納米孔的直徑僅允許單個(gè)核苷酸聚合物通過(guò),而ATCG四種堿基的帶電性質(zhì)不同,因此通過(guò)電信號(hào)差異特征即可檢測(cè)出通過(guò)納米孔的堿基類型,從而實(shí)現(xiàn)測(cè)序。
目前百邁客實(shí)驗(yàn)室內(nèi)Nanopore平臺(tái)儀器除了MinION、GridION X5以外,已經(jīng)擁有三臺(tái)PromethION測(cè)序儀!是目前國(guó)內(nèi)占有量最多且全部?jī)x器均在運(yùn)行中的公司!
這能說(shuō)明什么呢?
說(shuō)明從此:
測(cè)序不再等!
大數(shù)據(jù)隨心測(cè)!
多量樣本同期測(cè)!
結(jié)果到手快人一步!
PromethION操作展示:
(實(shí)時(shí)操作)
(精準(zhǔn)上樣)
為什么要引進(jìn)這么多臺(tái)?當(dāng)然是為了增加產(chǎn)量啦,目前每臺(tái)每48小時(shí)可產(chǎn)出1TB哦。有人可能會(huì)問(wèn)能支持不同物種嗎?答案是當(dāng)然可以。請(qǐng)看下表:
草本
灌木
喬木
水產(chǎn)
動(dòng)物
作物
注:Species:分析的物種信息;SeqNum:各個(gè)長(zhǎng)度范圍內(nèi)序列的數(shù)目;SumBase:指各個(gè)長(zhǎng)度范圍內(nèi)序列的總長(zhǎng)度;N50Len:reads N50長(zhǎng)度;N90Len:readsN90長(zhǎng)度;MeanLen:平均reads長(zhǎng)度;MaxLen:最長(zhǎng)reads長(zhǎng)度;MeanQual:質(zhì)量值,準(zhǔn)確度=1-10^(-Q/10)
以上是目前百邁客在線項(xiàng)目中使用PromethION進(jìn)行測(cè)序的部分下機(jī)數(shù)據(jù)~相關(guān)數(shù)據(jù)實(shí)在太多啦(后臺(tái)數(shù)據(jù)不斷不斷的在更新)!這邊僅僅按照物種分類來(lái)給大家簡(jiǎn)短的展示一下針對(duì)不同類別物種的數(shù)據(jù)實(shí)際產(chǎn)出情況。根據(jù)物種本身雜合度、難抽提程度以及測(cè)序深度的不同會(huì)對(duì)測(cè)序及組裝結(jié)果有一定的影響哦~
無(wú)論是動(dòng)物植物還是微生物、無(wú)論是基因組轉(zhuǎn)錄組還是宏基因、無(wú)論是舊數(shù)據(jù)的更新還是高難度物種的破譯,Nanopore都能出彩表現(xiàn)~
北京百邁客生物科技有限公司是中國(guó)大陸一家全部通過(guò)?PromthION/GridION平臺(tái)及DNA/RNA樣本官方認(rèn)證的公司。
截至目前為止,百邁客已經(jīng)建立超過(guò)上百種物種類型的文庫(kù),擁有大量的項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)!無(wú)論是技術(shù)還是項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)上,我們都實(shí)力過(guò)硬!如今越來(lái)越多可喜的結(jié)果已經(jīng)交付到各位老師的手中~
截至今年12月,百邁客2018年合作文章影響因子累計(jì)超過(guò)500+!Nature Genetics、Nature Communications、Molecular Plant…合作項(xiàng)目文章源源不斷!
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