ONT全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序揭秘鐵死亡調(diào)控青光眼發(fā)病的機(jī)制

鐵死亡（Ferroptosis）是近幾年發(fā)現(xiàn)的一種新的細(xì)胞死亡方式，是指在小分子物質(zhì)誘導(dǎo)下發(fā)生的氧化性細(xì)胞死亡，具有鐵離子依賴(lài)性。近年來(lái)，鐵死亡已成為當(dāng)前生命科學(xué)與基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究的一大熱點(diǎn)，在近幾年國(guó)家自然科學(xué)基金的資助項(xiàng)目中，鐵死亡相關(guān)項(xiàng)目的比例呈指數(shù)增長(zhǎng)。

2022年8月，百邁客合作客戶(hù)中南大學(xué)湘雅醫(yī)院眼科中心/湖南省眼科重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室夏曉波教授團(tuán)隊(duì)在《Nature》子刊《Cell Death & Differentiation》（IF：12.067，中科院一區(qū)）發(fā)表了研究成果“Pathologically high intraocular pressure disturbs normal iron homeostasis and leads to retinal ganglion cell ferroptosis in glaucoma”（病理性高眼壓干擾正常鐵穩(wěn)態(tài)并誘導(dǎo)青光眼視網(wǎng)膜神經(jīng)節(jié)細(xì)胞鐵死亡），首次報(bào)道了鐵死亡與青光眼發(fā)病機(jī)制的研究。百邁客為該研究提供了ONT全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組建庫(kù)測(cè)序分析服務(wù)。

研究背景

病理性高眼壓：青光眼是全球首位不可逆的致盲性眼病，可累及各年齡階段人群，臨床表現(xiàn)為進(jìn)行性的視野缺損和視神經(jīng)損害，視網(wǎng)膜神經(jīng)節(jié)細(xì)胞（RGC，視網(wǎng)膜唯一的中樞傳入神經(jīng)元）的選擇性和不可逆性丟失是青光眼病理?yè)p害的基礎(chǔ)。病理性高眼壓（pathological high intraocular pressure，ph-IOP）是青光眼發(fā)病的重要特征，也是導(dǎo)致青光眼RGC丟失的主要因素。通過(guò)藥物或手術(shù)途徑降低青光眼患者的ph-IOP是目前臨床中治療青光眼的唯一有效方法，但單純控制ph-IOP并不能完全阻止青光眼RGCs的丟失，臨床中很多青光眼患者在Ph-IOP控制至正常水平后，RGC丟失和視野損害仍在繼續(xù)，其具體的原因尚不完全清楚并存有爭(zhēng)議。

鐵死亡：是近幾年發(fā)現(xiàn)的一種新的細(xì)胞死亡方式，是在小分子物質(zhì)誘導(dǎo)下發(fā)生的氧化性細(xì)胞死亡，具有鐵離子依賴(lài)性，其發(fā)生是細(xì)胞內(nèi)脂質(zhì)活性氧（reactive oxygen species，ROS）生成與降解的平衡失調(diào)所致。鐵死亡誘導(dǎo)劑通過(guò)不同的通路直接或間接作用于谷胱甘肽過(guò)氧化物酶（glutathione peroxidase，GPXs），導(dǎo)致細(xì)胞抗氧化能力降低、ROS堆積、最終引起細(xì)胞氧化性死亡。鐵死亡不僅與眾多疾病的發(fā)生發(fā)展有關(guān)，其相關(guān)信號(hào)通路上的關(guān)鍵蛋白也可成為藥物的作用靶點(diǎn)，多種鐵離子螯合劑以及親脂性自由基捕獲型抗氧化劑可以抑制這種細(xì)胞死亡

材料方法

1）Ph-IOP損傷模型構(gòu)建：體內(nèi)模型–利用鹽水灌注系統(tǒng)，增加小鼠眼球前房壓力，誘導(dǎo)Ph-IOP損傷；體外模型–R28細(xì)胞的氧糖剝奪/復(fù)氧（OGD/R）損傷模型；

2）ONT全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序：在ph-IOP損傷或假手術(shù)組（sham）誘導(dǎo)后24 h，收集小鼠視網(wǎng)膜，將4個(gè)單獨(dú)的視網(wǎng)膜合并為一個(gè)樣本，每組包含三個(gè)樣本，分別進(jìn)行ONT全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序。

3）指標(biāo)檢測(cè)：視網(wǎng)膜氧化應(yīng)激–丙二醛（MDA）、煙酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸酯還原形式（NADPH）和谷胱甘肽（GSH）；高效液相色譜HLPC–檢測(cè)小鼠血清和視網(wǎng)膜的去鐵酮（DFP，脂溶性鐵螯合劑）給藥后的濃度；視網(wǎng)膜形態(tài)分析–H&E染色測(cè)量小鼠視網(wǎng)膜切片的形態(tài)；鐵離子檢測(cè)–Perl’s染色法檢測(cè)視網(wǎng)膜各層中鐵的分布、使用Iron Assay Kit盒(MAK025；Sigma)測(cè)量血清和視網(wǎng)膜的鐵水平（總鐵、二價(jià)鐵和三價(jià)鐵）；掃描透射電子顯微鏡TEM–測(cè)定RGCs具有鐵濃縮特征的線(xiàn)粒體。

研究結(jié)論

1. 通過(guò)分析急性原發(fā)性閉角型青光眼（APACG，Ph-IOP損傷最典型的一類(lèi)青光眼）患者外周血清鐵離子含量發(fā)現(xiàn)，青光眼患者血清中三價(jià)鐵離子含量較正常人群升高，推測(cè)鐵代謝可能參與調(diào)控了ph-IOP條件下RGC的損傷過(guò)程；

2. 體外和體內(nèi)實(shí)驗(yàn)證實(shí)了，ph-IOP可以在損傷早期導(dǎo)致細(xì)胞和視網(wǎng)膜內(nèi)二價(jià)鐵離子異常積累，損傷后8h血清中三價(jià)鐵離子水平升高；

3. 進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)，核受體共激活劑4（NCOA4）介導(dǎo)的鐵蛋白重多肽1（FTH1）的降解是導(dǎo)致ph-IOP損傷后視網(wǎng)膜內(nèi)鐵代謝紊亂的重要原因，體內(nèi)敲低Ncoa4的表達(dá)可抑制FTH1的降解，并降低視網(wǎng)膜中二價(jià)鐵的水平；

4. ph-IOP導(dǎo)致的鐵代謝紊亂可以通過(guò)增加視網(wǎng)膜促鐵死亡因子的表達(dá)，減少抑鐵死亡因子的表達(dá)誘導(dǎo)RGC發(fā)生鐵死亡，加重青光眼損傷；去鐵酮口服后可有效通過(guò)血-視網(wǎng)膜屏障，ph-IOP損傷后螯合視網(wǎng)膜內(nèi)異常升高的二價(jià)鐵，抑制RGCs鐵死亡，保護(hù)視覺(jué)功能。

總之，該研究首次揭示了NCOA4-FTH1介導(dǎo)的鐵代謝紊亂及鐵死亡在青光眼RGCs損傷中的作用，證明了去鐵酮靶向抑制RGC鐵死亡對(duì)青光眼的治療作用，為從鐵穩(wěn)態(tài)及鐵死亡途徑理解和治療青光眼提供了新的研究方向。

主要研究結(jié)果

1、Ph-IOP 損傷擾亂鐵穩(wěn)態(tài)

檢測(cè) APACG 患者和健康對(duì)照者的血清鐵含量發(fā)現(xiàn)，APACG 患者血清的總鐵和三價(jià)鐵水平高于健康對(duì)照組（圖1b），但二價(jià)鐵含量的變化并不顯著；與對(duì)照組相比，ph-IOP損傷體外模型組的細(xì)胞質(zhì)中二價(jià)鐵顯著積累。

在ph-IOP損傷或假手術(shù)組（sham）誘導(dǎo)后24 h的小鼠視網(wǎng)膜進(jìn)行ONT全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析，結(jié)果顯示，在 ph-IOP 損傷后，29個(gè)鐵代謝相關(guān)基因的轉(zhuǎn)錄水平顯著改變（圖1d)；此外，與正常小鼠相比，ph-IOP 損傷后1h和8h，視網(wǎng)膜和血清總鐵水平均升高（圖1e, f）。這些結(jié)果顯示ph-IOP 干擾了正常的鐵穩(wěn)態(tài)，導(dǎo)致體內(nèi)和體外鐵離子的顯著積累，這主要發(fā)生在 ph-IOP 損傷后的早期。

2、NCOA4介導(dǎo)的FTH1降解導(dǎo)致 ph-IOP 誘導(dǎo)鐵離子積累

鐵蛋白（Ferritin）是一種廣泛存在的儲(chǔ)鐵蛋白，在 ph-IOP 損傷后1小時(shí)，F(xiàn)TH1（Ferritin亞基）的水平急劇下降（圖2h），這與 ph-IOP 損傷后早期的鐵積累一致；鐵自噬（ferritinophagy）是一種調(diào)節(jié)細(xì)胞內(nèi)鐵代謝的選擇性自噬，檢測(cè)視網(wǎng)膜內(nèi)源性NCOA4（鐵自噬關(guān)鍵調(diào)節(jié)蛋白）蛋白水平發(fā)現(xiàn)，pH-IOP 損傷后NCOA4與 FTH1之間的內(nèi)源性相互作用增強(qiáng)（圖2i, j）；敲降Ncoa4后增加了視網(wǎng)膜 FTH1水平（圖2m-o），并伴隨著 ph-IOP 損傷后視網(wǎng)膜中二價(jià)鐵離子水平的降低（圖2p）。

3、Ph-IOP損傷誘導(dǎo)鐵累積導(dǎo)致早期視網(wǎng)膜鐵死亡

為了驗(yàn)證PH-IOP損失引起的視網(wǎng)膜鐵積累可能導(dǎo)致視網(wǎng)膜鐵死亡這一假設(shè)，測(cè)量了氧化應(yīng)激相關(guān)生化指標(biāo)，發(fā)現(xiàn)Ph-IOP損傷早期階段MDA含量顯著增加，而GSH和NADPH水平顯著降低；進(jìn)一步檢測(cè)鐵死亡核心標(biāo)志物GPX4（抑鐵死亡因子）和ACSL4（促鐵死亡因子）發(fā)現(xiàn)，ph-IOP 損傷后24h，GPX4水平降低，在PH-IOP損傷后1h，ACSL4水平上調(diào)（圖3d-f）；并且這些鐵死亡相關(guān)蛋白的變化主要集中在視網(wǎng)膜內(nèi)層，尤其是神經(jīng)節(jié)層（圖3g, h），提示鐵死亡誘導(dǎo)的細(xì)胞損傷可能集中在 RGC 中（位于視網(wǎng)膜最內(nèi)層）；TEM檢測(cè)發(fā)現(xiàn)PH-IOP引起RGC線(xiàn)粒體收縮和線(xiàn)粒體膜密度增加，表明ph-IOP誘導(dǎo)的視網(wǎng)膜鐵累積導(dǎo)致視網(wǎng)膜鐵死亡，特別是在 RGC中。

4、去鐵酮減少Ph-IOP損傷誘導(dǎo)的鐵離子累積

去鐵酮DPF作為鐵螯合劑目前已應(yīng)用于臨床治療鐵超負(fù)荷疾病，阻止患者血清鐵的蓄積。進(jìn)一步研究DFP對(duì)ph-IOP損傷小鼠鐵代謝的影響。體內(nèi)體外結(jié)果顯示，DFP處理可以顯著降低 ph-IOP誘導(dǎo)的視網(wǎng)膜二價(jià)鐵累積；DFP治療可降低ph-IOP損傷后視網(wǎng)膜MDA含量（圖4a），增加GSH和NADPH水平(圖5b, c )；此外，在ph-IOP損傷小鼠中，DFP處理恢復(fù)了GPX4水平，并降低了ACSL4水平(圖5d-e）。以上結(jié)果表明，DFP可以改善ph-IOP誘導(dǎo)的視網(wǎng)膜鐵死亡。

5、DFP抑制ph-IOP 損傷引起的RGC鐵死亡

H&E染色結(jié)果顯示，Ph-IOP損傷導(dǎo)致顯著的RGC丟失和視功能損害；接著從形態(tài)學(xué)和功能上驗(yàn)證了DFP對(duì)RGC的藥理作用，在 ph-IOP 損傷后5天，DFP處理減弱了神經(jīng)節(jié)細(xì)胞復(fù)合體（GCC）厚度，并增加了RGC數(shù)量（FG標(biāo)記RGC形態(tài)）。這些結(jié)果表明，DFP在ph-IOP損傷后保護(hù) RGC 損傷，因此使用DFP抑制鐵死亡是治療ph-IOP誘導(dǎo)的RGC 損失的有效治療策略。

研究小結(jié)

在生理狀態(tài)下，細(xì)胞內(nèi)鐵處于動(dòng)態(tài)平衡狀態(tài)，但在病理狀態(tài)下，這種平衡會(huì)被打破。Ph-IOP 損傷可以激活RGC細(xì)胞內(nèi)的NCOA4，激活的NCOA4將結(jié)合FTH1并觸發(fā)溶酶體降解FTH1（稱(chēng)為鐵自噬）。降解的FTH1會(huì)釋放大量的游離鐵離子，這種具有氧化還原活性的金屬會(huì)進(jìn)一步參與脂質(zhì)過(guò)氧化。最終，由鐵引起的脂質(zhì)過(guò)氧化氫的積累導(dǎo)致RGC鐵死亡，但口服DFP可以螯合細(xì)胞內(nèi)多余的游離鐵離子，抑制ph-IOP誘導(dǎo)的RGC鐵死亡。

參考文獻(xiàn)
Yao F, Peng J, Zhang E, et al. Pathologically high intraocular pressure disturbs normal iron homeostasis and leads to retinal ganglion cell ferroptosis in glaucoma [published online ahead of print, 2022 Aug 6]. Cell Death Differ. 2022;10.1038/s41418-022-01046-4. doi:10.1038/s41418-022-01046-4

ONT全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組優(yōu)勢(shì)

如果您對(duì)nanopore全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組技術(shù)感興趣，歡迎點(diǎn)擊下方按鈕聯(lián)系我們，我們將免費(fèi)為您設(shè)計(jì)文章思路方案。