三代微生物多樣性是基于?PacBio?測(cè)序平臺(tái)，利用單分子實(shí)時(shí)測(cè)序（SMRT Cell）的方法，基于HIFI模式對(duì)對(duì)單一片段進(jìn)行多輪測(cè)序，在確保測(cè)序片段的長(zhǎng)度的同時(shí)，也確保了單一片段測(cè)序數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性。基于其超長(zhǎng)讀長(zhǎng)的特點(diǎn)，可直接獲得全部變異區(qū)序列信息，獲得到“種”的分類鑒定，從而更加真實(shí)地還原樣本中微生物的群落結(jié)構(gòu)。
經(jīng)過不斷的經(jīng)驗(yàn)積累，百邁客目前已擁有3500+項(xiàng)目交付，80000+樣本測(cè)序經(jīng)驗(yàn)，研究成果涵蓋土壤，淤泥，根際，水體，深海冷泉，沉積物，反應(yīng)器，發(fā)酵體系，腸道，糞便等多種組織類型，平均單篇影響因子8分以上，助力客戶進(jìn)入精細(xì)微生物組研究時(shí)代。下面我們一起來看下文章案例思路~
客戶案例一：全長(zhǎng)微生物多樣性（細(xì)菌全長(zhǎng) 16S）+ 細(xì)菌框架圖助力客戶解析油茶根內(nèi)生菌Streptomyces sp. CoT10的磷周轉(zhuǎn)機(jī)制和促進(jìn)植物根際調(diào)節(jié)。
文章題目：Siderophores, a potential phosphate solubilizer from the endophyte Streptomyces sp. CoT10, improved phosphorus mobilization for host plant growth and rhizosphere modulation
期刊名稱：Journal of Cleaner Production
影響因子：11.072
發(fā)表時(shí)間：2022年7月
合作單位：湖南大學(xué)
研究?jī)?nèi)容：土壤中的可用磷（AP）缺乏是農(nóng)業(yè)和林業(yè)生產(chǎn)中的一個(gè)重要限制因素。因此，具有高磷動(dòng)員能力的微生物是非常值得關(guān)注的，特別是在酸性土壤中，大部分P被Fe固定。油茶是一種典型的酸性土壤種植油料作物，在我國(guó)林業(yè)經(jīng)濟(jì)體系中具有較高的地位。在這項(xiàng)研究中，作者從油茶內(nèi)生菌中篩選并鑒定了鏈霉菌株CoT10。CoT10可以有效地調(diào)動(dòng)不同的P資源，特別是對(duì)FePO4表現(xiàn)出高溶解度，并在生產(chǎn)不同的副產(chǎn)物方面表現(xiàn)突出。接種CoT10改善了土壤微生物多樣性，放線菌、變形菌、厚壁菌等優(yōu)勢(shì)群的比例明顯增多。此外，冗余分析（RDA）、網(wǎng)絡(luò)分析和功能預(yù)測(cè)表明，接種CoT10改善了油茶根際土壤中的微生物相互作用，平衡了土壤微生物P和Fe相關(guān)的功能作用。CoT10及其鐵載體為調(diào)節(jié)富鐵土壤中磷的遷移提供了一種有價(jià)值的方法，以促進(jìn)植物相關(guān)產(chǎn)業(yè)的可持續(xù)和生態(tài)友好型發(fā)展。
客戶案例二：全長(zhǎng)微生物多樣性（細(xì)菌全長(zhǎng) 16S）+ 代謝組聯(lián)合分析助力客戶定向分離能夠增強(qiáng)海稻耐鹽性的根際植物生長(zhǎng)促進(jìn)菌。
文章題目：Microbiome-metabolome analysis directed isolation of rhizobacteria capable of enhancing salt tolerance of Sea Rice 86
期刊名稱：Science of The Total Environment
影響因子：10.753
發(fā)表時(shí)間：2022年6月
合作單位：廣東海洋大學(xué)
研究?jī)?nèi)容：土壤鹽堿化被認(rèn)為是導(dǎo)致耕地面積和全球植物生產(chǎn)力減少的主要因素之一。應(yīng)用耐鹽植物和提高植物耐鹽性被認(rèn)為是鹽漬土恢復(fù)和利用的主要途徑。海稻86（SR86）被稱為能夠在鹽堿土壤中生長(zhǎng)的水稻品種，本研究以SR86幼苗不同鹽度下根際細(xì)菌多樣性和土壤代謝組為研究對(duì)象，了解其對(duì)植物耐鹽性的貢獻(xiàn)。研究發(fā)現(xiàn)鹽脅迫可以顯著改變根際細(xì)菌多樣性和根際代謝物。通過共生分析確定了關(guān)鍵分類群，關(guān)鍵分類群與根際代謝物之間的相關(guān)性分析表明，脂類及其衍生物可能在植物耐鹽性中發(fā)揮重要作用。此外，進(jìn)一步分離出了四種能夠促進(jìn)SR86耐鹽的植物生長(zhǎng)促進(jìn)菌（PGPR），并對(duì)其進(jìn)行了表征。研究結(jié)果可為植物-微生物相互作用介導(dǎo)的植物耐鹽機(jī)制提供新的思路，促進(jìn)PGPR在鹽漬土恢復(fù)利用中的分離和應(yīng)用。
客戶案例三：全長(zhǎng)微生物多樣性（細(xì)菌全長(zhǎng) 16S ?+ 古菌全長(zhǎng) 16S）+ 宏基因組助力客戶探索嗜化原核生物如何驅(qū)動(dòng)中國(guó)南海絕跡冷泉的碳、硫、氮循環(huán)。
文章題目：Riddles of Lost City: Chemotrophic Prokaryotes Drives Carbon, Sulfur, and Nitrogen Cycling at an Extinct Cold Seep, South China Sea
期刊名稱：Microbiology spectrum
影響因子：?9.043
發(fā)表時(shí)間：2022年12月
客戶單位：中國(guó)科學(xué)院南海海洋研究所
研究?jī)?nèi)容：深海冷泉是由流體攜帶的碳?xì)浠衔锞S持生產(chǎn)力的生態(tài)系統(tǒng)之一。一旦流體停止，繁榮的自養(yǎng)群落就會(huì)消亡，被稱為絕跡冷泉。但異養(yǎng)生物群甚至可以存活數(shù)千年。原核生物在活躍冷泉中的關(guān)鍵作用已明確，但迄今為止人們對(duì)它們?cè)诮^跡冷泉中的功能知之甚少。此研究闡明了南海海馬冷泉已絕跡冷泉地點(diǎn)沉積物原核生物的多樣性、分類特異性、種間相關(guān)性和代謝特征。與活躍冷泉相比，已絕跡冷泉的古菌α多樣性顯著增加，而細(xì)菌的α多樣性保持不變。然而，基于加權(quán)層面，古菌組成在活躍或非活躍位點(diǎn)的絕跡冷泉處沒有顯著差異，而細(xì)菌組成表現(xiàn)出顯著差異。古菌和細(xì)菌的分布在已絕跡的冷泉中表現(xiàn)出明顯的特異性，表明了這里獨(dú)特的生命特征。原核生物可能在無機(jī)碳、硫和氮的循環(huán)中以化學(xué)自養(yǎng)方式生活，或在碳?xì)浠衔锏难h(huán)中以化學(xué)有機(jī)體營(yíng)養(yǎng)的方式生活。值得注意的是，許多已絕跡的冷泉特定物種和網(wǎng)絡(luò)的關(guān)鍵譜系被歸類為變形桿菌。關(guān)于該分支的功能多樣性和代謝靈活性，變形桿菌被認(rèn)為整合了地球化學(xué)循環(huán)，并在絕跡冷泉微生物組的能量和資源補(bǔ)充中發(fā)揮關(guān)鍵作用?？偟膩碚f，研究結(jié)果揭示了已絕跡冷泉中的微生物生態(tài)學(xué)和功能多樣性，為流體停止后的生物地球化學(xué)循環(huán)提供了新的理解。
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