
學(xué)術(shù)交流
德國萊布尼茨植物遺傳與作物研究所Nils Stein研究員?講述了自2012年第一個(gè)大麥基因發(fā)表以來,染色體水平大麥及中國春小麥等麥類基因組研究的發(fā)展歷程。介紹了大麥遺傳多樣性與地理起源,并講述了大麥泛基因組相關(guān)研究。最后Nils教授表示泛基因組研究在基因挖掘、育種和變異等方面研究具有重要意義。
Nils Stein研究員報(bào)告
河南農(nóng)業(yè)大學(xué)王道文研究員詳述了黑麥具有較大的基因組特征(~7 – 8 Gb),其抗寒、抗病、抗逆和耐旱等多種優(yōu)良的特性對(duì)谷物研究和生產(chǎn)帶來了巨大貢獻(xiàn)。并對(duì)黑麥染色體的進(jìn)化,特別是與水稻、小麥、大麥的染色體的結(jié)合進(jìn)行了闡述。介紹了中國黑麥細(xì)胞遺傳學(xué)和育種研究相關(guān)進(jìn)程與成果。表示黑麥泛基因組研究將擴(kuò)大對(duì)黑麥基因組多樣性的了解,促進(jìn)黑麥、小黑麥和小麥的更有效改良。最后王道文研究員表示基因組學(xué)知識(shí)和基因組學(xué)工具正在給作物改良帶來新一輪的綠色革命。
王道文研究員報(bào)告
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德國萊布尼茨植物遺傳與作物研究所Timothy Rabanus-Wallace 博士講述了黑麥基因組破譯所面臨的挑戰(zhàn),并細(xì)致全面的講述了本次研究聯(lián)合短讀長、Hi-C、10×Genomics、遺傳圖譜及光學(xué)圖譜等技術(shù)如何破譯歐洲栽培黑麥“Lo7”基因組。解析了黑麥基因間空間的演化,以及抗病、抗寒與自交不親和等生物學(xué)過程的發(fā)生與作用機(jī)制,揭示了黑麥易位染色體片段對(duì)小麥遺傳改良的重要作用。Timothy 博士表示,未來可以基于品種間Hi-C基因組定位,在威寧黑麥和Lo7基因組間進(jìn)行系統(tǒng)的結(jié)構(gòu)比較,研究不同品系黑麥基因組間的大片段結(jié)構(gòu)變異。
Timothy Rabanus-Wallace 博士報(bào)告
河南農(nóng)業(yè)大學(xué)李廣偉博士系統(tǒng)解析了黑麥的演化歷史,展示了黑麥的分類起源和世界遺傳資源分布,并表示黑麥作為全球麥類基因資源具有重要的研究意義。通過中國栽培種“威寧黑麥”基因組的高質(zhì)量精細(xì)物理圖譜的構(gòu)建,展示了其復(fù)雜的基因組特征、復(fù)雜的染色體變異以及淀粉合成、儲(chǔ)存蛋白、抽穗期及馴化等相關(guān)基因的詳細(xì)機(jī)制。最后李廣偉博士表示威寧黑麥基因組的破譯對(duì)深化比較谷類基因組研究,加速黑麥及相關(guān)谷類作物的遺傳改良具有重要價(jià)值。
李廣偉博士報(bào)告
北京百邁客生物科技有限公司李緒明 展示了現(xiàn)在基因組研究中運(yùn)用的主流測(cè)序技術(shù)原理及各自特征。并通過麥類基因組發(fā)表歷程及百邁客實(shí)際項(xiàng)目產(chǎn)出情況,系統(tǒng)了講述了PacBio與Nanopore平臺(tái)各自特點(diǎn)。同時(shí)也展示了高雜合、高重復(fù)、染色體條數(shù)繁多等問題對(duì)基因組研究帶來的巨大挑戰(zhàn),以及本次威寧黑麥基因組在面對(duì)這些挑戰(zhàn)時(shí)所做出的積極應(yīng)對(duì)方案。提出了目前主流的基因組測(cè)序方案與組裝流程,并通過多個(gè)復(fù)雜的基因組項(xiàng)目案例展示了百邁客在基因組組裝上的超高水平。最后李緒明對(duì)基因組組裝技術(shù)的革新以及未來完整基因組的面世做出了展望。
李緒明先生報(bào)告
在濃厚的學(xué)術(shù)氛圍下,“黑麥科研合作成果NG論文國際學(xué)術(shù)交流會(huì)”成功落下了帷幕!通過這次交流會(huì),充分展示了麥類基因組學(xué)研究領(lǐng)域的重大進(jìn)展,加強(qiáng)了行業(yè)信息與資源的共享,共同促進(jìn)農(nóng)業(yè)科學(xué)發(fā)展,將對(duì)我國功能基因組學(xué)研究的深入和發(fā)展起到推動(dòng)作用。
詳細(xì)文獻(xiàn)解讀可點(diǎn)擊:百邁客合作||Nature Genetics高質(zhì)量黑麥基因組揭示重要的農(nóng)藝基因
百邁客生物科技有限公司(Biomarker Technologies)成立于2009年5月,是一家高新技術(shù)企業(yè),公司基于功能基因組學(xué)的BT+IT(高通量基因測(cè)序技術(shù)、生物信息技術(shù)、高性能生物云計(jì)算技術(shù))技術(shù),面向廣大科研工作者提供以綜合科技服務(wù)、BMKCloud生物云分析、二代及三代高通量測(cè)序分析,儀器,試劑等為主的科技服務(wù)。公司目前擁有Nanopore、Pacbio、Illumina、Waters、10X genomics等主流服務(wù)平臺(tái),構(gòu)建了基于云架構(gòu)的自主生物云計(jì)算分析平臺(tái)—百邁客云,提供涵蓋人重外顯子、三維基因組、單細(xì)胞與空間轉(zhuǎn)錄組、基因組de novo、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、微生物、群體遺傳、質(zhì)譜及表觀遺傳等研究方向的技術(shù)服務(wù)。自公司成立起,服務(wù)客戶在《Cell》、《Nature》、《Nature Genetics》、《Nature Communications》、《Plant Cell》、《PNAS》等學(xué)術(shù)刊物發(fā)表論文數(shù)千篇。