2021年10月19日,由北京百邁客生物科技有限公司主辦的“第八屆全國功能基因組學(xué)高峰論壇-微生物分會場”線上直播會議完美落幕。
全國功能基因組學(xué)高峰論壇始于2014年,每年舉辦一屆,至今已成功舉辦八屆,累計(jì)邀請近800名專家學(xué)者進(jìn)行大會主題報(bào)告,7000余名與會科研人員、近百家大眾及行業(yè)合作伙伴、媒體朋友參加此盛會,在業(yè)界形成了較高的行業(yè)影響力和認(rèn)可度。
大會得到了各位專家、學(xué)者的大力支持,本次論壇微生物分會場共邀請到中國科學(xué)院水生生物研究所繆煒研究員、山東大學(xué)張玉忠教授、自然資源部第三海洋研究所龔林鋒助理研究員、中國科學(xué)院海洋研究所趙峰副研究員、中國地質(zhì)大學(xué)(武漢)王紅梅教授、中科院遺傳發(fā)育所劉永鑫高級工程師、中南大學(xué)腫瘤研究所周文研究員、廣東省微生物研究所謝黎煒研究員、內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)孫志宏研究員、中國科學(xué)院北京生命科學(xué)研究院趙方慶研究員等10位著名專家學(xué)者,共同探討研究進(jìn)展及發(fā)展方向。此外,百邁客微生物產(chǎn)品部副總監(jiān)王年和珀金埃爾默企業(yè)管理(上海)有限公司資深應(yīng)用專家王萌也帶來了主題報(bào)告。
大會精彩報(bào)告
中國科學(xué)院水生生物研究所繆煒研究員介紹了“萬種原生生物基因組計(jì)劃”,2019年12月30日,由中國科學(xué)院水生生物研究所聯(lián)合西藏大學(xué)、河南農(nóng)業(yè)大學(xué)、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蘭州獸醫(yī)研究所、中國科學(xué)院北京基因組研究所和華中科技大學(xué)等單位共同發(fā)起“萬種原生生物基因組計(jì)劃”(Protist 10,000 Genomes Project, 簡稱P10K),旨在繪制萬種代表性原生生物基因組圖譜,建立一個大規(guī)模的原生生物遺傳資源數(shù)據(jù)庫。
山東大學(xué)張玉忠教授講述了“海洋微生物的多樣性、獨(dú)特的生命特征及其適應(yīng)與進(jìn)化機(jī)制:基因組分析與整合生物學(xué)研究。”張老師團(tuán)隊(duì)首先從基因組層面,系統(tǒng)揭示了深海、極地海域微生物的多樣性及生物地理分布特征;然后,揭示了深海、極地海域微生物獨(dú)特的生命特征及極端環(huán)境適應(yīng)與進(jìn)化的基因組學(xué)證據(jù)。在此基礎(chǔ)上,從微生物生理學(xué)、遺傳學(xué)、生物化學(xué)與結(jié)構(gòu)生物學(xué)等多個層面,系統(tǒng)闡明深海、極地海域微生物獨(dú)特的生命特征、環(huán)境適應(yīng)與生態(tài)效應(yīng)的分子機(jī)制,為開發(fā)利用深海、極地海域微生物及其基因資源奠定理論基礎(chǔ)。
圖片
自然資源部第三海洋研究所龔林鋒助理研究員向大家介紹了“深海(熱液)生物資源和空間信息大數(shù)據(jù)平臺”,該平臺是基于“標(biāo)準(zhǔn)建設(shè),安全保障,高效共享,全面服務(wù)”理念,建立以空間信息系統(tǒng)、海洋環(huán)境數(shù)據(jù)為基礎(chǔ)的,一系列專業(yè)的樣品、(微)生物、微生物菌株、基因、化合物的實(shí)物信息和基因信息大數(shù)據(jù)平臺,將為深海生物資源的科學(xué)研究、開發(fā)利用和服務(wù)共享提供巨大支撐。
中國科學(xué)院海洋研究所趙峰副研究員介紹了“深海真核微生物分子多樣性與地理分布”趙老師團(tuán)隊(duì)利用高通量DNA測序研究了從潮間帶到大陸架,直至深海平原、海山和熱液區(qū)沉積物中真核微生物的多樣性和地理分布模式。溯源分析表明:大陸架和深海平原源-匯關(guān)系比其他生境更緊密,生境差異對群落變異的貢獻(xiàn)大于空間變量和水深。
中國地質(zhì)大學(xué)(武漢)王紅梅教授的報(bào)告題目:“洞穴地下生物圈的組成、功能及生態(tài)學(xué)意義”,王教授向大家介紹了洞穴生態(tài)系統(tǒng),洞穴是開發(fā)抗生素等新藥物的重要來源。隨后介紹了洞穴地下生物圈中的微生物:組成及功能,針對大氣甲烷氧化菌進(jìn)行詳細(xì)講述。最后對未來大氣甲烷氧化菌的未來發(fā)展方向進(jìn)行了展望。
百邁客生物科技有限公司微生物產(chǎn)品部王年副總監(jiān)帶來報(bào)告“升級微生物組研究的幾款利器”主要介紹了微生物組研究技術(shù),詳細(xì)介紹了百邁客對PacBio 全長擴(kuò)增子產(chǎn)品的研發(fā)投入,促使技術(shù)普及,包括串聯(lián)建庫體系,以及配套的生信算法和專有數(shù)據(jù)庫輔助注釋。同時,也介紹了nanopore測序技術(shù)在宏基因組測序上的優(yōu)勢和應(yīng)用場景。緊接著介紹了微生物組和代謝組聯(lián)合分析研究思路。最后,介紹了如何利用百邁客云平臺為科學(xué)研究提效。
中科院遺傳發(fā)育所劉永鑫高級工程師的報(bào)告題目是“擴(kuò)增子和宏基因組數(shù)據(jù)分析與可視化流程”。劉老師首先介紹了微生物組研究技術(shù),研究方法,詳細(xì)介紹了分析流程及相關(guān)軟件。對當(dāng)前宏基因組數(shù)據(jù)分析的主流方法進(jìn)行整理和總結(jié),為同領(lǐng)域研究者更方便、靈活的開展數(shù)據(jù)分析,快速選擇研究分析工具,高效挖掘數(shù)據(jù)背后的生物學(xué)意義提供參考,進(jìn)一步推動微生物組研究領(lǐng)域的發(fā)展。
中南大學(xué)腫瘤研究所周文研究員的報(bào)告題目是“多發(fā)性骨髓瘤腸道微生物-宿主代謝互作機(jī)制及干預(yù)”,周老師首先介紹了多發(fā)性骨髓瘤(Multiple Myeloma, MM)的特點(diǎn),隨后介紹了課題組利用宏基因組測序技術(shù)得到的發(fā)現(xiàn),MM患者腸道微生物生態(tài)紊亂,并出現(xiàn)氮源微生物的優(yōu)勢生長,腸道微生物-宿主代謝兩者互作從而加速宿主MM的腫瘤進(jìn)程。通過干預(yù)MM患者腸道菌群和氮源攝入可作為MM治療的新靶標(biāo)。
廣東省微生物研究所謝黎煒研究員講解了“腸道微生物:代謝性疾病的干預(yù)窗口”謝老師首先介紹了腸道菌群是多因素誘發(fā)肥胖癥的承載體,代謝性疾病,例如:2型糖尿病,肥胖和代謝性肝病等,嚴(yán)重?fù)p害身體健康,甚至致殘致死。研究發(fā)現(xiàn)代謝性疾病的發(fā)生和發(fā)展伴隨腸道微生物多樣性、種類和功能的變化,謝老師團(tuán)隊(duì)近期開展的短期理床低碳減重研究和益生菌代謝產(chǎn)物緩解機(jī)體糖脂代謝的研究為代謝性疾病的腸道干預(yù)提供了有力的證據(jù)。
內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)孫志宏研究員課題組靳煒博士帶來了“基于納米孔的宏基因組測序揭示了人類腸道微生物基因組的暗物質(zhì)”的主題報(bào)告,靳老師介紹了人類腸道微生物組研究進(jìn)展,提出因?yàn)榻^大多數(shù)研究采用二代測序,導(dǎo)致了無法解決基因組重復(fù)區(qū)的問題,并使組裝連續(xù)受到限制。孫老師課題組整合了來自180個人類腸道樣本的3.7Tbp Nanopore平臺和21.6Tb Illumina平臺高質(zhì)量宏基因組數(shù)據(jù),并從中還原符合高質(zhì)量MIMAG標(biāo)準(zhǔn)的宏基因組組裝基因組(MAGs)。該方法將第三代與第二代超深度測序相結(jié)合,大幅提高了宏基因組組裝的準(zhǔn)確性和連續(xù)性。
中國科學(xué)院北京生命科學(xué)研究院趙方慶研究員的報(bào)告主題為“微生物組:金礦還是泡沫?”趙老師提出高通量測序技術(shù)為基礎(chǔ)的微生物組學(xué)已經(jīng)是目前最為關(guān)鍵和成熟的組學(xué)方法,也已成為基因組研究領(lǐng)域最活躍的方向之一。趙老師團(tuán)隊(duì)重點(diǎn)開發(fā)了多種微生物組學(xué)研究的新技術(shù)和新方法,包括:RiboFR-seq、metaSort、inGAP-sf、inGAP-CDG和CRIPSR-network等。為高效解讀微生物組提供了全新的技術(shù)手段。
PerkinElmer公司資深應(yīng)用專家王萌帶來了“PerkinElmer樣本質(zhì)控及NGS整體解決方案”報(bào)告,向大家詳細(xì)介紹了基于樣品質(zhì)控金標(biāo)準(zhǔn)的LabChip微流控技術(shù),它可以提供全面、高質(zhì)量的核酸質(zhì)控?cái)?shù)據(jù)。隨后介紹了LabChip GX Touch提供的全面核酸樣本分析及應(yīng)用案例展示,以及PerkinElmer的NGS全流程解決方案。最后,介紹了PerkinElmer explorer G3全自動平臺,可運(yùn)用于全自動化超高通量NGS文庫構(gòu)建,新冠萬人份核酸檢測等。
在濃厚的學(xué)術(shù)氛圍下,第八屆百邁客全國功能基因組學(xué)高峰論壇-微生物分會場落下了帷幕!通過這次峰會,充分展示了功能基因組學(xué)研究領(lǐng)域的重大進(jìn)展,加強(qiáng)了行業(yè)信息與資源的共享,促進(jìn)了該領(lǐng)域的交流與合作,將對我國功能基因組學(xué)研究的深入和發(fā)展起到推動作用。
相信每一位參會人員都受益匪淺,也祝愿每一位研究學(xué)者都能喜報(bào)頻頻!讓我們共同期待2022年“第九屆全國功能基因組學(xué)高峰論壇”,我們將繼續(xù)秉承大會“解讀基因、助力科研”的使命,努力將此論壇打造成行業(yè)標(biāo)桿性學(xué)術(shù)交流盛會!